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“基因魔剪”給癌細(xì)胞打上獨(dú)特標(biāo)記 繪制癌細(xì)胞演化圖譜

2021-01-28 08:35:55來源:科技日報  

據(jù)最新一期《科學(xué)》雜志報道,美國科學(xué)家使用CRISPR基因編輯技術(shù),給每個癌細(xì)胞打上獨(dú)特標(biāo)記,繪制出一個詳細(xì)的癌細(xì)胞演化圖譜。新研究不但更清晰地描述了癌癥轉(zhuǎn)移背后的動態(tài)過程,而且發(fā)現(xiàn)了促進(jìn)癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的“熱點(diǎn)”基因和“中轉(zhuǎn)樞紐”。

當(dāng)癌癥僅限于體內(nèi)某個部位時,通常可以通過手術(shù)或其他方法來治療。然而,與癌癥有關(guān)的大部分死亡由癌細(xì)胞在全身的轉(zhuǎn)移造成。轉(zhuǎn)移的確切時刻非常短暫,常常淹沒在腫瘤中發(fā)生的數(shù)百萬次分裂中。這些事件通常無法實(shí)時監(jiān)測。

在新研究中,研究人員使用了人類KRAS突變型肺癌小鼠模型,并用編碼Cas9蛋白的基因改造了癌細(xì)胞。當(dāng)小鼠體內(nèi)的癌細(xì)胞不斷分裂增殖時,Cas9在目標(biāo)DNA位點(diǎn)進(jìn)行不斷剪切,而癌細(xì)胞的DNA修復(fù)機(jī)制會不斷修補(bǔ)這些缺口,它會修補(bǔ)或刪除一些隨機(jī)的核苷酸,從而形成被稱為“插入/缺失”(indel)的獨(dú)特修復(fù)序列。這些序列會隨著細(xì)胞的分裂一代代地傳遞下去,成為每個癌細(xì)胞攜帶的獨(dú)特標(biāo)記。

這種剪切和修復(fù)幾乎在每一代中都是隨機(jī)發(fā)生的,由此可以畫出非常精細(xì)的癌細(xì)胞演化圖譜——顯示轉(zhuǎn)移的癌細(xì)胞在體內(nèi)的擴(kuò)散路徑和方向。

研究人員發(fā)現(xiàn),這些癌細(xì)胞盡管來自同一細(xì)胞系,但在移植后轉(zhuǎn)移的路線不同。對此,研究人員認(rèn)為,隨著原始癌細(xì)胞系經(jīng)過多代分裂,癌細(xì)胞似乎發(fā)展出了不同的轉(zhuǎn)移特性。

有的癌細(xì)胞和它的所有后代都只在一個組織中出現(xiàn),這意味著它們沒有發(fā)生轉(zhuǎn)移;而另一些癌細(xì)胞的后代則在多個組織中出現(xiàn)。

研究人員開始在這些具有不同轉(zhuǎn)移特性的癌細(xì)胞系中尋找差異表達(dá)基因。通過單細(xì)胞RNA測序,研究人員在比較了具有不同轉(zhuǎn)移潛力的癌細(xì)胞的基因表達(dá)圖譜后發(fā)現(xiàn),IF127和REG4等基因的高度表達(dá)與高轉(zhuǎn)移潛力相關(guān);而KRT17和RPS4Y1等基因的表達(dá)與低轉(zhuǎn)移潛力相關(guān)。研究團(tuán)隊(duì)通過敲除或過表達(dá)KRT17基因,證明該基因?qū)嶋H上控制了腫瘤的侵襲性。

能夠以這種方式識別與轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因可以幫助研究人員回答有關(guān)腫瘤如何進(jìn)化和適應(yīng)的問題。參與研究的麻省理工學(xué)院教授喬納森·魏斯曼說:“這是一種觀察腫瘤行為和進(jìn)化的全新方法。”

利用癌細(xì)胞演化圖譜,研究人員還發(fā)現(xiàn)了癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移行為的特定特征。許多癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的第一步是從肺部轉(zhuǎn)移到縱隔淋巴組織這個“中轉(zhuǎn)樞紐”,這表明在小鼠模型中,這一部位與癌細(xì)胞向體內(nèi)擴(kuò)散密切相關(guān)。

魏斯曼博士表示,這些“中轉(zhuǎn)樞紐”的發(fā)現(xiàn)在抗癌療法開發(fā)方面具有重要意義。“如果你把癌癥治療的重點(diǎn)放在這些部位,你就可以第一時間延緩或者預(yù)防癌癥轉(zhuǎn)移的發(fā)生。”(馮衛(wèi)東)

責(zé)任編輯:hnmd003

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